Riksdagen har antagit mål för miljökvaliteten inom sexton områden. De beskriver den kvalitet och det tillstånd för Sveriges miljö, natur- och kulturresurser som är ekologiskt hållbara på lång sikt. Målen ska nås inom en generation - till 2020.
Arbetet i Klart vatten anknyter till hälften av dem, men framför allt till miljömålet: ”Grundvatten av god kvalitet”. Målbeskrivning är att grundvattnet ska ge en säker och hållbar dricksvattenförsörjning samt bidra till en god livsmiljö för växter och djur i sjöar och vattendrag.